新農合和醫保在覆蓋對象，繳費主體，繳費標準以及繳費方式上有所區別。

醫保和新農合的區別：

1、所覆蓋的對象不同。

職工醫療保險是城鎮所有用人單位，包括企業(國有企業、集體企業、外商投資企業、私營企業等)、機關、事業單位、社會團體、民辦非企業單位及其職工，都要參加。鄉鎮企業及其職工、城鎮個體經濟組織業主及其從業人員是否參加基本醫療保險，由各省、自治區、直轄市人民政府決定。新農合必須是有農村戶口才可以辦理。

2、繳費主體不同。

職工醫療保險是指國家通過立法強制規定，用人單位和社會成員個人共同繳納醫療保險費，建立醫療保險基金。新型農村合作醫療制度是由政府組織、引導、支持，農民自愿參加，個人、集體和政府多方籌資，以大病統籌為主的農民醫療互助共濟制度。

3、繳費方式不同。

醫療保險具有強制性，是單位和職工共同繳納的，并需要繳納時間達到一定的年限。新型農村合作醫療是農民自愿參加，而且必須以家庭為單位整戶參加，且需要每年辦理參保繳費手續。

4、繳費標準不同。

職工基本醫療保險繳費和個人工資有關，按照相關規定的比例標準繳納，分為幾檔可以選擇，一般單位承擔8%，個人承擔2%。職工醫保的繳費標準遠高于新農合。

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