新型農村合作醫療報銷范圍為：參加人員在統籌期內因病在定點醫院住院診治所產生的藥費、檢查費、化驗費、手術費、治療費、護理費等符合城鎮職工醫療保險報銷范圍的部分（即有效醫藥費用）。

以下這些情況農村合作醫療不予以報銷：

（1）非正常轉正到上級醫院（未經參保地醫院治療，擅自到非定點地區就醫）；

（2）非因疾病產生的費用（諸如免責條款中提到的美容、整容、鑲牙等費用)；

（3）非因自身原因產生的費用（新農合不保障意外傷害，比如交通事故、工傷、第三人侵權等）；

（4）違法行為導致自身受傷（例如免責條款中提到的自殘、自殺、幅度、打架斗毆等）。

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