流式細胞術這種圖怎么畫的 流式細胞儀的結果一般都是機器自帶的軟件生成的,也可以使用第三方軟件,比如Flowjo來讀取機器生成的FCS格式文件而生成 要不去下載flowjo 或其他流式分析軟件研究一下就會作圖了,流式圖必須是專業(yè)分析軟件才能分析,
FlowJo 是一款流式數(shù)據(jù)分析軟件,可以分析所有流式儀產(chǎn)生的數(shù)據(jù),具有多平臺版本。它簡單易用、功能強大,已被領域內研究所、大學廣泛使用,是科學期刊使用最多的軟件之一,可以說是最好的流式數(shù)據(jù)分析軟件。本次主要講解如何運用它科學地處理流式數(shù)據(jù)。
材料/工具
flowjo 7.6.1
死細胞一般要通過染料染色,比如PI陽性的細胞,來排除。如果沒有事先染色,只是通過FSC-SSC來看,會很不準。
方法
打開軟件flowjo 7.6.1,鼠標直接拖動數(shù)據(jù)所在文件夾到軟件中,則數(shù)據(jù)導入。
3.1 圖形窗口中對縱軸的調整:3.1.1 打開“option”選項,3.1.2 在“Y Axis”中選擇“Auto”或者“Manual”,Auto:自動,能自動調整Y軸的范圍,將整個直方圖顯示出來Manual:手動,需要在后面的“Max”選項中手動輸入Y軸標度的最大值,然后按“回車鍵”確認
對數(shù)據(jù)進行處理:雙擊fcs格式數(shù)據(jù)出現(xiàn)流式散點圖(建議首先對空白組細胞先處理),圈門(根據(jù)實驗目的選擇合適的圈門工具)并點擊ok確定。
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雙擊圈門部位,根據(jù)實驗目的以及染料的熒光激發(fā)/發(fā)射波長,選擇流式圖合適的橫坐標和縱坐標。完成后,關閉處理界面,回到軟件主界面。
細胞周期至少有兩種做法,最常見的如下圖分析: 這個是BrdU和7-AAD方法檢測細胞周期。紅色的gate就是G1期,綠色的就是S期,橙色的就是G2/M期。BrdU, PI, 或者EdU方法和這個一樣分析 如果單用PI等DNA染料染色,需要專業(yè)軟件來分析計算了。 比如這
對其他數(shù)據(jù)進行批處理,鼠標拖動已處理文件到All samples。
你并不需要一樣的軟件,任何可以分享FCS文件的軟件都可以,目前還有網(wǎng)絡為基礎的,跨平臺的免費軟件。redmatterapp.com 這個軟件完全免費,而且電腦,手機,平板都可以使用。只要你建一個賬戶,把流式的數(shù)據(jù)上傳后就可以分析了。 BD的軟件都可以
點擊布局管理器。并拖動已處理文件到布局管理器內。
流式細胞儀都是fcs格式的文件, 很多軟件都可以讀 ,收費的有FlowJo, Metlab,。還有其他一些免費的
輸出圖片,可以點擊保存按鈕(命名時需要輸入后綴.png),或者在圖片右擊復制然后黏貼到PPT/Word中。
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流式細胞儀分析軟件flow jo中table editor的statistic中沒有count選項
frequent 就是計數(shù)啊更多追問追答追問frequent of是百分比,我說的是細胞個數(shù)。追答你上機記錄樣本數(shù)目的時候,就已經(jīng)設置好了,讓機器記錄多少,所以你的總數(shù)是固定的。有百分比就可以得到細胞數(shù)呀追問這個是輸出數(shù)據(jù)的時候,不能導出細胞數(shù)。大概是破解版的*,用了正版就好了。
muse流式細胞儀結果用什么軟件讀取
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如何分析流式細胞儀檢測t淋巴細胞亞群結果
最常見zd的是分析CD4, CD8亞群。
先在FSC, SSC散點圖上劃出淋巴細胞gate。然后在此gate基礎上選取T細胞標志染色陽性的細胞群(一般是CD3)。在把CD34陽性的細胞根據(jù)CD4 和CD8染*況形式為散點圖,得到CD4+/CD8-, CD4-/CD8+, 以及雙陽性的比率。如果還有其他細胞標志的染色,再進一步分析。
流式細胞儀 直方圖分析怎么做峰疊加圖,類似下圖。cellquest pro
這個很簡單的,在菜單中點plot,然后在下來菜單中選中overlay,再選取要疊加的文件就可以了
新手流式細胞周期flowjo分析求助
流式細胞周期flowjo分析有文獻的啊,可以查詢看看
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